Autorka i redaktorka 12 książek i ponad 100 artykułów naukowych. Specjalizuje się w estetyce filozoficznej. Jej zainteresowania naukowe koncentrują się na historii estetyki polskiej, problemach estetyki i sztuki współczesnej oraz badaniach dotyczących doświadczenia czasu, przeszłości oraz historii i pamięci w kontekście procesów estetyzacji. Od 2002 roku pełni funkcję wiceprezesa i członka zarządu Polskiego Towarzystwa Estetycznego. Współorganizowała dwa Polskie Kongresy Estetyczne (2006, 2010) i Światowy Kongres Estetyki w 2013 roku. Jest autorką i recenzentką projektów wydawniczych serii Klasycy Estetyki Polskiej, znaną w środowisku naukowym organizatorką ogólnopolskich interdyscyplinarnych konferencji, poświęconych współczesnej kulturze i sztuce. Pod redakcją prof. Pękali ukazała się pierwsza anglojęzyczna publikacja poświęcona recepcji twórczości znanego polskiego filozofa i artysty – S.I.Witkiewicza.